该院始建于1957年6月1日。内设长春市儿童医学研究所、长春市残疾儿童康复中心。是一所集医疗、科研、教学、康复为一体的吉林省唯一一所大型综合儿童医院，1994年被卫生部命名为三级甲等医院。2000年经吉林省卫生厅批准成立了吉林省儿童重症疾病治疗中心。2002年经长春市卫生局批准成立了国内首家长春护理管理集团。现为吉林大学教学医院、硕士生基地、吉林省护理培训基地、国际紧急救援中心网络医院。并与北京儿童医院联合成立了专家会诊中心。

       全院在职职工922人，卫生技术人员697人，其中主任医师27人，副主任医师86人，中级职称244人，有9人享受国务院政府特殊津贴，2人享受市政府特殊津贴。省级拔尖人才1人，市级拔尖人才3人，市级学科带头人12人，兼职教授、副教授25人，硕士生导师7人。

        医院设有急诊、内、外、五官、皮肤、口腔等21个临床科室，新生儿内科为市级重点专科，7个医技科室，儿病研究室为省级重点研究室。全年就诊患儿37万人次，住院患儿近13,000人次。近年来，医院先后建立了心理咨询、脑瘫康复、中医中药、矮小、肥胖、哮喘、癫痫、儿童驱铅、儿童营养、儿童女科、少男少女、近视弱视等眼病治疗、验光配镜、口腔正畸等13个特色门诊。针对儿童特点建立了物理治疗中心，开展了26种新疗法。建起了门诊急诊监护室（ICU），进一步完善了急诊绿色通道。为满足先天性心脏病患儿的就医需求，医院建立了小儿心胸外科，成功实施心脏手术，目前无一例死亡。为方便患儿的需求，医院还设立了特需病房，集整体护理与家庭式服务于一体，取得了良好的社会效益。医院在静点观察疗区精心修建了儿童乐园，配备了电视动画片，消除了患儿就医的恐惧和家长的烦躁心理。

      建院49年来，医院共有37项科研成果荣获省、市科技进步奖，研究成果达国内先进或领先水平，荣获省、市新技术引进奖64项，国家专利5项，国家级论著11部。其中护理科研5项，2项获国家专利。 

       医院现拥有全身CT、DR、彩超、体外循环机、小儿麻醉机、小儿呼吸机、全自动生化分析仪、尿流式细胞计数仪、血凝仪，原子吸收分光光度计、动态脑电图仪、生理监测仪等一大批国内外先进的医疗设备。

       随着一批批优质、高效低耗的诊疗手段和高、精、尖端的手术疗法的推广和应用，跨越近半个世纪沧桑的长春市儿童医院，将以更加精湛的技术、更加优质的服务，迎接入世挑战，为祖国未来托起希望的太阳。